Baktériumölő és fertőtlenítő hatása mellett a kakukkfű az egyik legerősebb hurutoldó gyógynövény. Kiválóan alkalmazható a tüdő és a légcső gyulladásos megbetegedéseinél, valamint arcüreggyulladás esetén.

A tüdő hörgőire gyakorolt kedvező hatása miatt dohányosok idült légzőszervi betegségeinek is fontos gyógynövénye.